O comando varia para cada versão que você tenha instalado, observe que no caso do Ubuntu temos 3 opções diferentes na loja do Windows, então o comando deve ser o correto ou não funcionará.
O comando deve ser executado em uma janela do CMD ou do PowerShell, de preferência como administrador e antes de ter aberto o bash do Linux desde a ultima vez que reiniciou o computador.
(Ubuntu) ubuntu config --default-user root
(Ubuntu 18.04 LTS)
ubuntu1804 config --default-user root
(Ubuntu 16.04 LTS)
ubuntu1604 config --default-user root
(openSUSE Leap 42) openSUSE-42 config --default-user root
(SUSE Linux) SLES-12 config --default-user root
(Debian) debian config --default-user root
(Kali Linux) kali config --default-user root
